Telegram Web Link
Forwarded from mozhgan Shabani
در ساختمان DNA پلیمراز lll باکتریایی زیرواحد اپسیلون دارای چه عملکردی می باشد؟ ( زیست شناسی ارشد)
Anonymous Quiz
23%
پلیمرازی
44%
اگزونوکلئازی '5 <=== '3
19%
افزایش processivity
14%
دیمریزاسیون دو core آنزیم
Forwarded from mozhgan Shabani
کدام آنزیم طی همانندسازی، نوکلئوتیدهای پیش ساز RNA را با نوکلئوتیدهای DNA جایگزین میکند؟(نانوتکنولوژی پزشکی ،ارشد)
Anonymous Quiz
24%
RNA Polymerase
39%
DNA Polymerase l
21%
DNA Polymerase ll
17%
DNA Polymerase lll
🏡خانه لودیش📚
کدام عبارت دیر در مورد قطعه klenow fragment صحیح نمی باشد؟ (دکتری علوم سلولی کاربردی)
پاسخ صحیح گزینه 3


(ا) DNA پلیمراز l توسط پروتئازها به دو قطعه تبدیل می شود:

1 _قطعه کوچک : این قطعه ۳۵ کیلو دالتون وزن دارد و دارای عملکرد'3<==='5 اگزونوکلئازی است که با این فعالیت، قطعات پرایمر و بخش های آسیب دیده DNA را حذف می کند.

2_ قطعه بزرگ: این قطعه کلنو (Klenow) نام دارد و ۷۶ کیلو دالتون وزن دارد که دارای عملکرد های '5<==='3 اگزونوکلئازی و '3 <==== '5 پلیمرازی است.

https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🏡خانه لودیش📚
در ساختمان DNA پلیمراز lll باکتریایی زیرواحد اپسیلون دارای چه عملکردی می باشد؟ ( زیست شناسی ارشد)
پاسخ صحیح گزینه 2


(ا) DNA پلیمراز های دلتا و آلفا و اپسیلون که در همانند سازی DNA نقش دارند. از دسته DNA پلیمراز های نوع B هستند ، که دارای خاصیت غلط گیری (اگزونوکلئازی '5<==='3 ) را دارند.

(ا) DNA پلیمراز بتا ، لامبدا ،سیگما و مو از دسته DNAپلیمراز نوع X هستند.
بتا در سیستم ترمیم برش باز نقش دارد.
لامبدا و مو در سیستم ترمیم اتصال انتهای غیر همولوگ نقش دارد.

(ا) DNA پلیمراز های کاپا، ایتا و آیوتا از دسته DNA پلیمرهای نوع Y هستند. این آنزیم ها فاقد خاصیت غلط گیری هستند و در ترمیم مستعد خطا نقش دارند .



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🏡خانه لودیش📚
کدام آنزیم طی همانندسازی، نوکلئوتیدهای پیش ساز RNA را با نوکلئوتیدهای DNA جایگزین میکند؟(نانوتکنولوژی پزشکی ،ارشد)
پاسخ صحیح گزینه 2



قطعه کوچک DNA پلیمراز l این قطعه ۳۵ کیلو دالتون وزن دارد و دارای عملکرد'3<==='5 اگزونوکلئازی است که با این فعالیت، قطعات پرایمر و بخش های آسیب دیده DNA را حذف می کند.


https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🏡خانه لودیش📚
کدام یک از عبارات زیر در مورد DNA Polymerase در سلول های پستانداران صحیح است؟( علوم سلولی کاربردی، دکتری)
پاسخ صحیح گزینه 3

(ا) DNA پلیمراز های دلتا و آلفا و اپسیلون که در همانند سازی DNA نقش دارند. از دسته DNA پلیمراز های نوع B هستند ، که دارای خاصیت غلط گیری (اگزونوکلئازی '5<==='3 ) را دارند.

(ا) سنتز رشته پیشرو توسط DNA پلیمراز اپسیلون و سنتز رشته پیرو توسط DNA پلیمراز دلتا انجام میگیرد.

(ا)‌قطعات اوکازاکی توسط DNA پلیمراز دلتا ساخته می شود.

(ا) همانند سازی DNA میتوکندری توسط DNA پلیمراز گاما صورت می گیرد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🏡خانه لودیش📚
کدام گزینه صحیح است؟ (زیست شناسی ،ارشد )
پاسخ صحیح گزینه 4


در ابتدای فرایند همانند سازی تعدادی پروتئین به نام DnaA به نواحی 9 مری متصل می شود.

پروتئین DnaA دارای خاصیت ATPase است که در دمین C _ترمینال آن این ویژگی وجود دارد . DnaA در واقع وظیفه شناسایی محل ori برعهده دارد.

اتصال مولکول های DnaA به یکدیگر علامتی است برای شروع همانند سازی و این اتصال به صورت یک مجموعه هگزامری است.

همزمان با پیچیده شدن DNA به دوره هگزامری DnaA ، پروتئین های دیگری وارد عمل می‌شوند یکی از این پروتئین‌ها DnaB است که وظیفه هلیکازی را برعهده دارد و این مولکول های DnaB به تنهایی نمی تواند به محل همانندسازی برسند و نیاز به یک مولکول عامل به نام DnaC دارد. DnaB پیوند هیدروژنی را در ابتدای همانند سازی میشکند ،DnaB به صورت یک مولکول هگزامر در ساختار وارد عمل می‌شود و برای فراخوانی هر مولکول DnaB ما نیاز به یک مولکول DnaC داریم.(در نتیجه به 6 عدد DnaC نیاز داریم), DnaC دارای خاصیت مهارکنندگی برای DnaB است و با مصرف ATP از DnaB جدا می شود.



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg


🧬🧬🧬mutation🧬🧬🧬




🧬 DNA damage can be caused by spontaneous cleavage of chemical bonds in DNA, by environmental agents such as ultraviolet and ionizing radiation, and by reaction with genotoxic chemicals that are by-products of normal cellular metabolism or occur in the environment.



🧬 آسیب DNA می تواند به صورت
شکست خودبه خودی در پیوند شیمیایی DNA به وسیله عوامل محیطی از قبیل پرتوهای فرابنفش و پرتوهای یونیزه کننده و یا به وسیله واکنش با ترکیبات شیمیایی ژنوتوکسیک که به طور طبیعی درمتابولیسم سلولی تولید شده و یا در محیط وجود دارند، به وجود آید.


https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg


🎗Proofreading by DNA polymerase




🧬🧬Many copying errors that occur during DNA replication are corrected by the proofreading function of DNA polymerases, which can recognize incorrect (mispaired) bases at the 3′ end of the growing strand and then remove them by means of an inherent
3′→5′ exonuclease activity.



🎗تصحیح خطا توسط DNA پلیمراز


🧬🧬بسیاری از اشتباهات که در هنگام همانندسازی DNA رخ میدهد توسط فرآیند تصحیح خطا اصلاح می شوند. در این فرآیند DNA پلیمراز می تواند بازهای اشتباه (ناجور جفت شده) را
در انتهای '۳ زنجیره در حال رشد شناسایی کرده و توسط فعالیت '۵<----'۳ اگزونوکلئازی ذاتی خود آنها را بردارد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg


💢💢Base excision repair in E.coli💢💢



🔺Base excision repair (BER) typically acts on subtle base damage. This process begins with a DNA glycosylase, which extrudes a base in a damaged base pair, then clips out the damaged base, leaving an apurinic or apyrimidinic site that attracts the DNA repair enzymes that remove the remaining deoxyribose phosphate and replace it with a normal nucleotide. In bacteria, DNA polymerase I is the enzyme that fills in the missing nucleotide in BER; in eukaryotes, DNA polymerase b plays this role.
However, this enzyme makes mistakes, and has no proofreading activity, so APE1 carries out the necessary proofreading.



💢💢💢ترمیم برش بازی در E.coli💢💢💢

🔺ترمیم برش بازی (BER) عمدتا بر روی آسیب دیدگی بازی جزئی عمل می کند. این فرآیند با
یک DNA گلیکوزیلاز آغاز می شود که باز مورد نظر در ناحیه ی جفت باز آسیب دیده را خارج می کند، سپس باز آسیب دیده را حذف کرده و جایگاه فاقد پورین و یا پیریمیدین را ایجاد می کند که این حالت سبب فراخوانی آنزیم های ترمیمی DNA می شود که دزوکسی ریبوز فسفات باقی مانده را حذف کرده و آن را با یک نوکلئوتید طبیعی جایگزین می کند. در باکتری ها ، DNA پلیمراز l است که ناحیه ی فاقد نوکلئوتید را در BER پر میکند، و در یوکاریوت ها، آنزیم DNA پلیمراز بتا این نقش رو بازی میکند .
هرچند این آنزیم سبب ایجاد خطا می شود و فعالیت ویرایشی ندارد، ولی APE1 ویرایش لازم را انجام می دهد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🔆🔆Base excision repair in Eukaryotes🔆🔆


A DNA glycosylase , flips the thymine base out of the helix and then cuts it away from the sugar-phosphate DNA backbone , leaving just the deoxyribose phosphate . An
endonuclease specific for the resultant abasic site endonuclease I, (APE1) then cuts the DNA backbone, and the deoxyribose phosphate is removed by an endonuclease, AP lyas associated with DNA polymerase β, a specialized DNA polymerase used in repair. The gap is then filled in by DNA Pol β and sealed by DNA ligase.


🔆🔆ترمیم برش بازی در یوکاریوت ها 🔆🔆

یک DNA گلیکوزیلاز باز تیمین را به بیرون از مارپیچ DNA می کشاند و بعد آن را بریده و از قند جدا می سازد و فقط دئوکسی ریبوز باقی مانده .
سپس یک اندونوکلئاز خاص به نام AP
اندونکلئاز1 (APE1) برای جایگاه بدون باز ایجاد شده ، رشته DNA را برش می دهد و دئوکسی ریبوز فسفات توسط یک اندونوکلئاز به نام AP لیاز که با DNA پلیمراز بتا مرتبط است جدا می شود . DNA پلیمراز بتا نوعی خاص از DNA پلیمرازها است که در ترمیم استفاده می شود.
قطعه ای از رشته DNA که بریده شده بود توسط DNA پلیمراز بتا دوباره پر
می شود و DNA لیگاز lll , دو انتهای این قطعه تازه ساخته شده را به بقيه رشته متصل می کند .



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

🔷🔶Nucleotide excision repair in E.coli 🔷🔶



🔸Nucleotide excision repair typically handles bulky damage that distorts the DNA double helix. NER in E. coli begins when the damaged DNA is clipped by an endonuclease on either side of the lesion, at sites 12–13 nt apart. This allows the damaged DNA to be removed as part of the resulting
12–13-base oligonucleotide. DNA polymerase I fills the gap and DNA
ligase seals the final nick.



🔷🔶ترمیم برش نوکلئوتیدی در E.coli🔷🔶

🔸ترمیم برش نوکلئوتیدی عمدتا برای آسیب های
شدیدی که مارپیچ دورشتهی DNA را از شکل طبیعی خارج کنندبه کار می رود. NER
در E.coli زمانی آغاز می گردد که DNAی آسیب دیده توسط یک اندونوکلئاز واقع در دوطرف ناحیهی آسیب دیده، در جایگاه هایی با فاصله ی ۱۲ الى۱۳ نوکلئوتید بریده میشود. با این برش، DNAی آسیب دیده‌ به عنوان بخشی از یک الیگونوکلئوتید ۱۲ الی ۱۳ بازی حذف میشود. DNA پلیمراز I این فاصله را پر می کند و DNA
الیگاز شکاف های باقی مانده را می چسباند.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
2024/09/28 15:32:16
Back to Top
HTML Embed Code: