Telegram Web Link
🟪◼️Nucleotide excision repair in◼️🟪 human cells


◾️A DNA lesion that causes distortion of the double helix, such as a thymine_
thymine dimer, is initially recognized by a complex of the XP-C and 23B proteins .
This complex then recruits transcription factor TFIIH,whose helicase subunits,powered by ATP hydrolysis, partially unwind the double helix. XP-G and RPA proteins then bind to the complex and further unwind and stabilize the helix until a bubble of about 25 bases is formed Then XP-G (now acting as an endonuclease) and XP-F, a second endonuclease, cut the damaged strand at points 24–32 bases apart on each side of the lesion
This releases the DNA fragment with
the damaged bases, which is degraded to mononucleotides. Finally
the remaining nick is sealed by DNA ligase.





🟪◼️ترمیم برش نوکلئوتیدی در سلول های◼️🟪 انسانی


◾️یک آسیب DNA که می تواند ساختار مارپیچ دو رشته ای DNA را به هم بزند، مثل دایمر تیمین - تیمین، ابتدا توسط کمپلکسی از XP_C و پروتئین 23B تشخیص داده میشود.
سپس این کمپلکس، فاکتور رونویسی TFIIH را
به سمت خود می کشد. زیر واحدهای هلیکازی فاکتور TFIIH با مصرف ATP دو رشتهDNA
را به طور جزئی باز می کنند. بعد پروتئین های XP-C وRPA به این کمپلکس متصل شده و دو رشته DNA را بیشتر باز می کنند تا اینکه یک حباب حدودا ۲۵ بازی پدید می آید.
سپسXP_G (که اکنون به عنوان اندونوکلئاز عمل می کند) و XP_F (دومین اندونوکلئاز)، رشته آسیب دیده را در نقطه هایی با فاصله ۲۴ تا ۳۲ باز از هر طرف نقطه آسیب دیده، می برند.
در نتیجه قطعه DNA حاوی بازهای آسیب دیده رهامی شود و بعد تجزیه شده و به نوکلئوتیدهای مجزا تبدیل می شود. نهایتا ناحيه خالی توسط DNA پلیمراز، دقیقا مشابه همان چیزی که در
همانندسازی رخ می دهد، پر شده و DNA لیگاز این قطعه تازه ساخته شده را به بقيه رشته متصل می کند.


https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
⚫️⭕️⭕️Mismatch repair in E.coli⭕️⭕️⚫️


🔺The products of the mutH, L, and S genes along with ATP , recognize a base mismatch identify the newly synthesized strand by the
absence of methyl groups on GATC sequences, and introduce a nick into that new strand, across from a methylated GATC and upstream of the incorrect nucleotide.

🔺Exonuclease I, along with MutL, MutS, DNA helicase, and ATP, removes DNA downstream of the nick, including the incorrect nucleotide.

🔺DNA polymerase III holoenzyme, with help from single-stranded binding protein (SSB), fills in the gap left by the exonuclease, and DNA ligase seals the remaining nick.

🔺A methyltransferase methylates GATC sequences in the progeny strand across from methylated GATC sequences in the parental strand. Once this happens, mismatch repair nearby cannot occur because the progeny and parental strands are indistinguishable.



⚫️⭕️⭕️ترمیم جفت ناجور در E.coli⭕️⭕️⚫️

یا

⭕️ترمیم برش عدم تطابق در E.coli⭕️


🔻محصول ژن های MutH,L,S به همراه ATP یک جفت باز ناجور را تشخیص داده، رشته ی جدید ساخته شده را در غیاب گروه های متیل در توالی GATCشناسایی می کند و یک شکاف در داخل رشته ی جدید دور از محل یک GATC متیله شده و بالا دست نوکلئوتید ناصحیح ایجاد میکند.

🔻اگزونوکلئازی l به همراه DNAهلیکاز
و MutL ، Muts و ATP ، ناحیه پایین دست قسمت شکاف را حذف می کند که شامل نوکلئوتید ناصحیح هست.

🔻هولوآنزيم DNA پلیمراز III باکمک پروتئین متصل شونده به DNAی تک رشته (SSB)، ناحیه ی فضای خالی باقی مانده توسط اگزونوکلئاز را پر می کند و DNA لیگاز
شکاف باقی مانده را می چسباند.

🔻یک متیل ترانسفراز، توالی GATC را در رشته ی دختری درست در مقابل توالی GATC متیله شده در رشته ی والدی متیله میکند. این اتفاق فقط یک بار می افتد، پس ترمیم جفت ناجور پس از این متیله شدن نمی تواند رخ دهد زیرا رشته های والدي و دختری از یکدیگر قابل تشخیص نمی باشند.



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🔆🔅Mismatch excision repair in human cells


A complex of the MSH2 and MSH6 proteins binds to a mispaired segment of DNA in such a way as to distinguish between the template and the newly synthesized daughter strand.

This binding triggers binding of MLH1
and PMS2 The resulting DNA-protein
complex then binds an endonuclease that cuts the newly synthesized daughter strand. Next a DNA helicase unwinds the helix, and an exonuclease removes several nucleotides from the cut end of the daughter strand, including the mismatched base.

Finally, as with base excision repair, the gap is filled in by a DNA polymerase (Pol δ, in this case) and sealed by DNA ligase.


🔆🔅ترمیم برش عدم تطابق در سلول های انسانی


یک کمپلکس از پروتئینهای MSH2 و MSH6 به قطعه حاوی عدم تطابق DNA متصل می شود، به گونه ای که بین رشته های الگو و رشته دختری تازه سنتز شده تمایز قائل می شود.

این امر اتصال MLH1 و PMS2 را تحریک می کند. سپس کمپلکس پروتئین - DNA حاصله به یک اندونوکلئاز متصل می شود و این اندونوکلئاز، رشته دختری تازه سنتز شده را برش می دهد. سپس یک DNA هلیکاز، مارپیچ DNA را باز می کند و یک اگزونوکلئاز چندین نوکلئوتید از انتهای قطع شده رشته دختری را که شامل باز عدم تطابق میشود، جدا میکند.

در انتها، همانند ترمیم برش بازی، فضای خالی ایجاد شده توسط یک DNA پلیمراز ( دلتا) پر
شده و توسط یک DNA لیگاز قطعه جدید به بقیه رشته متصل می گردد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
🧬🧬Non Homologous End_Joining Repair



🧪🩸Double-strand DNA breaks in mammals can be repaired by homologous recombination or by
nonhomologous end joining.

🧪🩸The latter process requires Ku and DNA-PK DNA ends, constituting active DNA-PK complexes that allow the ends to find regions of microhomology with each other.

🧪🩸Once the regions of microhomology line up, the two DNA-PK complexes phosphorylate each other.
This phosphorylation activates the catalytic subunit (DNA-PK cs) to dissociate, and it also activates the DNA helicase activity of Ku to unwind the DNA ends so the microhomology regions can base-pair.
Finally, extra fl aps of DNA are removed, gaps are filled, and the DNA ends are ligated permanently together.



🧬🧬ترمیم اتصال انتهاهای غیر همولوگ 🧬🧬


🩸🧪شکست های دورشتهای DNA در پستانداران
می توانند توسط نوترکیبی هومولوگ و یا الحاق انتهاهای غیرهومولوگ ترمیم شوند.

🩸🧪فرآیند دوم به Ku و DNA-PKcs نیاز دارد که با یکدیگر به نواحی انتهایی DNA متصل شدهو سبب شکل گیری کمپلکس های DNA-PK فعال می گردند. این کمپلکس ها باعث می شوند تا نواحی انتهایی، مناطق دارای میکروهومولوژی با همدیگر را پیدا کنند.

🩸🧪هنگامی که مناطق دارای میکروهومولوژی ردیف می شوند، دوکمپلکس DNA-PK یکدیگر را فسفریله می کنند. این فسفریله شدن، زیر واحد کاتالیتیکی (DNA-PKcs) را جهت جدا شدن، فعال می کند و همچنین فعالیت DNA
هلیکازی Ku برای باز کردن نواحی انتهایی DNA فعال می شود بنابراین نواحی دارای میکروهومولوژی می توانند با هم جفت شوند. در آخر، نواحی آویزان اضافی در DNA حذف می شوند، فاصله ها پر می گردند و نواحی انتهای DNA برای همیشه به هم متصل می شوند.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

♣️Homologous Recombination

نوترکیبی همولوگ:

این روش در حین و بعد از همانندسازی استفاده
می شود و کروماتید خواهری بعنوان الگو برای ترمیم رشته آسیب دیده در دسترس می باشد.
این روش بدون خطا انجام می گیرد.

1_ ایجاد شکست دو رشته ای

2_ فعال سازی ATM کیناز توسط شکست دو رشته ای و فسفوریلاسیون و فعال سازی مجموعه ای از اگزو نوکلئازها که انتهای تک رشته ای در '3 بوجود می آورند. در فرایندی که وابسته به پروتئینهایBRCA1 و BRCA2 است، پروتئین Rad51 بر روی انتهای '3 DNA تک رشته ای پلی مریزه شده وفیلامنت نوکلئوپروتئینی تشکیل میدهد.

3_ فیلامنت نوکلئوپروتئینی Rad51 بر روی کروماتید خواهری توالی همولوگ را جستجو می کند تا انتهای '3 تک رشته ای با رشته مکمل خود بر روی رشته همولوگ جفت باز شود.

4_ یک DNA پلیمرازها این انتهای '3 را با استفاده از رشته الگو بر روی DNA همولوگ پلیمریزه کرده وادامه می دهند.

5_ انتهای '3 ترمیم شده از DNA صدمه دیده با انتهای '3 تک رشته ای از رشته دیگر همان DNA
جفت میشود.

6_ پر شدن شکافها توسط DNA پلیمرازها و DNA لیگاز

♣️♣️جهش در ژن های BRCA1 و BRCA2 با ایجاد سرطان سینه در زنان همراه است.


@lodishhome


مکانیسم ترمیمی که تاکنون شرح داده‌ام همگی فرایندهای واقعی ترمیمی هستند و آنها DNA ی آسیب دیده را به طور کامل حذف می‌کند.

شیوه ی دیگری برای مقابله با آسیب وجود دارد که در این روش آسیب حذف نمی‌شود اما به آسانی از آن عبور می کند این مکانیسم ها جز مکانیسم‌های ترمیمی محسوب می‌شوند هرچند که ترمیم صورت نمی‌گیرد. یکی از این سیستم ها، ترمیم های نوع ترکیبی DNA است.

ترمیم های که توسط نوترکیبی DNA ترمیم می شوند شامل:

1_ ترمیم چنگال همانندسازی فروپاشی شده

2_ترمیم شکست دو رشته‌ ای



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg


⬛️🔳Collapsed replication fork repair🔳⬛️


♦️ترمیم چنگال همانندسازی فروپاشی شده
♦️




1_ اگر شکست پیوند فسفو دی استر در یک رشته DNA قبل از تشکیل چنگال همانند سازی ترمیم نشود،باعث فروپاشی چنگال همانندسازی می شود.


2_اولین مرحله در این فرآیند،هضم اگزونوکلئازی رشته از انتهای '5 کروموزوم والدي است.

3_ پروتئین ضروری برای مرحله ی بعدی، RecA در باکتری ها و همولوگ آن یعنی 51 Rad در ساکاروماسیس سرویزیها و سایر یوکاریوتها است. چندین مولکول RecA/Rad51 به DNA تک رشته ای متصل شده و هیبریداسیون آن را با توالی مکمل در مولکول DNA دو رشته ای همولوگ خود کاتالیز می کنند. رشته ی مکمل این DNA دورشته ای، در ناحیه ی هیبریداسیون با رشته ی مهاجم به شکل حلقه ی تک رشته ای در می آید .

4_ تهاجم رشته با کمک RecA/Rad51 برای فرآیند نوترکیبی ضروری است. از آنجائیکه طی مراحل مختلف، هیچ بازی از دست نمی رود یا اضافه نمی شود، به این فرآیند تهاجم رشته گفته می شود. ناحیه ی هیبرید بین DNA هدف و رشته ی مهاجم توسط پروتئین با مصرف ATP توسعه پیدا می کند؛ این فرآیند مهاجرت شاخه نام دارد. زمانی که بخش هیبرید به سمت انتهای '5 ناحیه ی شکسته شده گسترش می یابد، ساختار هالیدی تشکیل می شود.

5 و 6_ برش پیوندهای فسفودی استری که از یک رشته ی والدی با رشته ی مکمل خود تقاطع یافته اند و اتصال دو انتهای '3 و '5 که با رشته های والدي مشابه جفت باز تشکیل داده اند، باعث ایجاد ساختاری مشابه با چنگال همانندسازی می شود.

7_بازسازی در پروتئین های چنگال همانندسازی منجر به گسترش رشته ی پیشرو بعد از نقطه ی شکست و شروع مجدد شك سنتز رشته ی پیرو می شود.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

🌟🌟 double-strand break repair🌟🌟


ترمیم شکست دو رشته ای



مکانیسم مشابهی نیز برای ترمیم شکست دورشته ای در کروموزوم به کار می رود و قطعات بزرگی از دو مولکول DNA دورشته ای با یکدیگر مبادله می شوند.


1_ دو انتهای شکسته شده در مولکول DNA توسط '5 اگزونوکلئاز هضم می شوند و انتهای '3 ایجاد می گردد.

2_یک RecACe در باکتری ها و Rad51 در یوکاریوتها موجب تهاجم یکی از رشته های دارای انتهای '3 به سمت ناحیه ی همولوگ کروموزوم دیگر می شوند.

3_ انتهای '3 رشته ی مهاجم توسط DNA پلیمراز گسترش می یابد تا اینکه است این رشته ی جابجاشده با انتهای ۳ رشته ی اولیه جفت باز تشکیل دهد.

4_ آنگاه انتهای '3 از طریق DNA پلیمراز و با استفاده از حلقه ی تک رشته ای ایجاد شده
توسط DNA والدی گسترش می یابد.

5_ انتهاهای '3 به انتهاهای '5 هضم شده توسط اگزونوکلئاز متصل می شوند. این فرآیند دو ساختار هالیدی در دو مولكول به وجود می آورد.

6_ مهاجرت شاخه در این ساختارهای هالیدی از هر دو جهت صورت می گیرد. در نهایت برش از رشته ها در محل پیکانهای نشان داده شده در شکل و اتصال دو انتهای '3 و '5 جدید، منجر به ایجاد کروموزوم های نوترکیب می گردد که حاوی DNA والدي اول در یک سمت و DNA والدى دوم در سمت دارن دیگر محل برش می باشد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
تا کنون فصل 5 لودیش به طور کامل فصل 9 حدودا 20 درصد فصل 10 حدودا 90 درصد در کانال به صورت فیلم ، ویس ، نکته و تست تدریس شده. 🔔🔔اکنون مطالب بعدی کانال رو شما انتخاب کنید⁉️⁉️
anonymous poll

مسیرهای پیام رسانی کنترل کننده بیان ژن – 57
👍👍👍👍👍👍👍 41%

چرخه سلولی ، آپوپتوز و سرطان – 47
👍👍👍👍👍👍 34%

انتقال پروتئین به غشا و اندامک ها – 19
👍👍 14%

انتقال پیام و گیرنده جفت شده با G پروتئن – 10
👍 7%

done – 6
👍 4%

👥 139 people voted so far.
🏡خانه لودیش📚 pinned «تا کنون فصل 5 لودیش به طور کامل فصل 9 حدودا 20 درصد فصل 10 حدودا 90 درصد در کانال به صورت فیلم ، ویس ، نکته و تست تدریس شده. 🔔🔔اکنون مطالب بعدی کانال رو شما انتخاب کنید⁉️⁉️ anonymous poll مسیرهای پیام رسانی کنترل کننده بیان ژن – 57 👍👍👍👍👍👍👍 41%…»


✒️✒️📚📝 #آزمون #رایگان📝📚🖋🖋


آزمون رایگان فصل 5 و 9 و 10 لودیش

برای شرکت در آزمون رایگان عضو شوید 👇
👇


@lodish_home


🖌✒️🖌✒️🖌✒️🖌✒️🖌✒️🖌✒️🖌✒️🖌✒️

https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg
♣️ اولین آزمون برگزار شد👊👊👊


♣️ با شرکت در آزمون های هفتگی رایگان و کسب بالاترین نمره ، تا آخرین روز کنکور خود مشاوره رایگان دریافت کنید.

♣️ زمان رو از دست نده و برای آزمون بعدی آماده شو 👇👇👇👇👇




@lodish_home
پاسخ آزمون 1.pdf
1.6 MB
#پاسخ_آزمون۱

#همانندسازی
#جهش
#ترمیم
#ترجمه



اصلاحیه

سوال ۹ ==> کدام گزینه درست است؟

سوال۱۴==> پاسخ صحیح گزینه ج




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

http://www.instagram.com/lodish.home
2024/09/28 13:21:13
Back to Top
HTML Embed Code: