The TBP subunit of TFIID is the first protein to bind to a
TATA box promoter. TBP interacts with the minor groove in DNA, bending the helix considerabl.

زیرواحد TBP مربوط به TFIID اولین پروتئینی است که به جعبه TATA متصل می شود.

این TPB با شیار کوچک DNA میانکنش برقرار می کند و مارپیچ DNA را به طور قابل ملاحظه ای خم می کند.



#لغات متن بالا

زیرواحد subunit

میانکنش،تعامل interacts

شیار کوچک minor groove

خم شدن bending

به طور قابل ملاحظه ای
considerably


https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

Elongation Factors Regulate the Initial Stages
of Transcription in the Promoter-Proximal

فاکتور های طویل سازی مراحل اولیه رونویسی در ناحیه نزدیک پروموتری را تنظیم میکنند.

#لغات متن بالا

فاکتور طویل سازی
Elongation Factors

تنظیم کردن Regulate

جایگاه رونویسی اولیه
Initial Stages of Transcription





https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

at most promoters,
Pol II pauses after tran-
scribing fewer than 100 nucleotides, due to the binding of
a five-subunit protein called NELF (negative elongation
factor).
NELF( DRB Sensitivity _Inducing factor) binds to Pol II along with a two-subunit
elongation factor called DSIF.

در بیشتر پروموترها، Pol II پس از رونویسی کم تر از ۱٠٠نوکلئوتید به علت اتصال به یک پروتئین 5 زیر واحدی به نام NELF ( فاکتور طویل سازی منفی) متوقف می شود. سپس عامل طویل سازی دو زیر واحدی به نام DSIF( عامل القا حساسیت DRB) به Pol ll متصل می شود.

#لغات متن بالا

متوقف می شود pauses

۵زیرواحدی five-subunit

فاکتور طویل سازی منفی
negative elongation factor

عامل القا حساسیتDRB
DRB Sensitivity_inducing factor




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

The inhibition of elongation that results from NELF binding to Pol II is relieved when DSIF, NELF, and serine 2 of the Pol ll
CTD (Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser) are phosphorylated
by a protein kinase with two subunits, cyclin T–CDK9, also
called P-TEFb, which associates with the Pol II-NELF-DSIF Complex


مهار طویل سازی Pol II در نتیجه اتصال NELF, با فسفریله شدن DSIF، NELF و سرین 2 از CTD پلیمراز II
(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)
توسط پروتئین کیناز دو زیرواحدی انجام می گیرد. این پروتئین CDK۹_cyclin T همچنین P_TEFb هم نامیده می شود، به کمپلکس NELF _DSIF_Pol ll متصل می شوند.


#لغات متن بالا

مهار inhibition

طویل سازی elongation

در نتیجه results

اتصال binding

همکاری کردن associates



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#لغات پرتکرار در کنکور


«آسیب پذیر»

Vulnerable

Susceptible

Pron

آسیب پذیری Susceptibility

آسیب پذیری در برابر
Vulnerability to _ Prone to

عدم آسیب پذیری
Invulnerablility



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

جواب سوال

۵s

#توضیحات بیشتر برای سوال

پلیمراز ll درون هستک قرار دارد و محصولات آن pre_rRN
(5.8s و 18sو 28s)

پلیمراز II درون نوکلئوپلاسم قرار دارد که محصولات آن mRNA
(hnRNA)و snRNA و miRNA و siRNA

پلیمراز III درون نوکلئوپلاسم قرارد دارد و محصولات آن tRNA و ۵sRNA و snRNA U۶ و ۷SLRNA (بخشی از SRP می باشد که این SRP پیامی برای ورود به داخل اندامک شبکه اندوپلاسمی می باشد)



@shaabaniazizi70

#پردازش پیش سازها ی pre_mRNA) mRNA)

۱_ کلاهک گذاری در انتهای ’5

7-Methylguanosine is joined to the 5’
end of almost all eukaryotic mRNAs in an unusual 5’،5_
triphosphate linkage.

۷_متیل گوانوزین به انتهای ’5 تقریبا تمام مولکول های mRNA یوکاریوتی از طریق پیوند غیرمعمول ’5،’5_تری فسفات اتصال می یابد.

methyl groups are often added at the 2’
hydroxyls of the first and second nucleotides adjacent
to the cap . The methyl groups are derived
from S-adenosylmethionin

غالبا گروهای متیل دیگری به گروه های ’2_هیدروکسیل اولین و دومین نوکلئوتید مجاور کلاهک افزوده میگردد. این گروهای متیل از S_آدنوزین متیونین مشتق شده اند.

Synthesis of the cap is carried out by enzymes tethered
to the CTD of Pol II. The cap remains tethered to the CTD throug an as_
sociation with the cap-bindi complex (CBC).

سنتز کلاهک توسط آنزیم متصل به دمین CTD مربوط به RNA پلیمراز II انجام می شود. کلاهک از طریق ارتباط با کمپلکس متصل شونده به کلاهک متصل باقی می ماند.


@shaabaniazizi70

#پردازش pre_mRNA


۲_پیرایش اینترون ها


There are four classes of introns. group I and group II introns They have several similarities:

1_they are self-splicin.
2_ Neither class requires a
phile in a similar reaction at the 39 end of the intron. The
high-energy cofactor (such as ATP)
3_The splicing mechanisms in both groups involve two trans-
esterification reaction steps.

۴کلاس از اینتروه هاوجود دارد.
اینترون های گروه l و ll دارای شباهت های هستند:
۱_ خود پیرایشگر هستند
۲_هیچ کدام از این دو گروه نیاز به کوفاکتورهای پر انژی (مثل ATP) ندارند.
۳_ مکانیسم پیرایش در هر دو گروه شامل دو واکنش ترانس استریفیکاسیون است.

The third and
largest class of introns includes those found in nuclear
mRNA primary transcripts. These are called spliceoso-
mal introns.

سومین و بزرگ ترین کلاس اینترون شامل اینترون های موجود در رونوشت اولیه mRNA هسته ای می باشد تحت عنوان اینترون های اسپلایسوزمومی نامیده می شود.


@shaabaniazizi70

#پردازش pre_mRNA


۳_ افزودن دم پلی A


At their 3’ end, most eukaryotic mRNAs have a string of
80 to 250 A residues, making up the poly(A) tail. This
tail serves as a binding site for one or more specific pro-
teins. The poly(A) tail and its associated proteins prob-
ably help protect mRNA from enzymatic destruction.
Many bacterial mRNAs also acquire poly(A) tails, but
these tails stimulate decay of
mRNA rather than pro-
tecting it from degradation.


در انتهای ’۳، اکثر مولکول های mRNA یوکاریوتی دارای زنجیره ای از ۸٠_۲۵٠ رزیدو آدنین هستند که دم پلی A را تشکیل می دهد. این دم به عنوان جایگاه اتصال برای یک یا چند پروتئین خاص به کار می رود. دم پلی A و پروتئین مرتبط با آن احتمالا باعث حفاظت mRNA از تجزیه آنزیمی می شود. بسیاری از مولکول های mRNA باکتری نیز دم پلی A به دست می آورند،اما این دنباله ها باعث تحریک تخریب mRNA به جای حفاظت از آن می شود.


@shaabaniazizi70

#خروج mRNA پردازش شده از هسته به سیتوپلاسم




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

Most mRNPs are exported from the nucleus by a heterodimeric mRNP exporter that interacts with unstructured protein domains that fill the central channel of the nuclear pore complex (NPC). The direction of transport (us to cytoplasm) results from dissociation of the mRNP exporter–mRNP complex in the cytoplasm due to the phosphorylation of mRNP adapter proteins by cytoplasmic kinases and the action of an RNA helicase associated with cytoplasmic filaments of the nuclear pore complexes. As a result, mRNP exporter–mRNP complexes diffuse down a concentration gradient across the NPC from the nucleus to the cytoplasm.

اغلب mRMA بوسیله خارج کننده mRNP هترودیمری هسته خارج می شوند. این خارج کننده ها با دمین پروتئینی فاقد ساختار که کانال مرکزی کمپلکس منفذ هسته (NPC) را پر می کند، میانکنش می دهد. جهت انتقال (هسته به سیتوپلاسم) ممکن است نتیجه پراکنده شدن کمپلکس mRNP _
خارج کننده در سیتوپلاسم بوسیله فسفریلاسیون پروتئین های mRNP با کینازهای سیتوپلاسمی و عملکرد RNAهلیکازی همراه با رشته های سیتوپلاسمی در کمپلکس منفذ هسته ای باشد در نتیجه، کمپلکس mRNP_خارج کننده در جهت شیب غلظت در عرض NPC از هسته به سیتوپلاسم انتشار می یابد.


mRNP exporter binds to most mRNAs cooperatively with SR proteins bound to exonic splicing enhancers and with REF associated with exon-junction complexes as well as with additional mRNP proteins.
خارج کننده mRNP با SR پروتئین های متصل به افزاینده های پیرایش اگزونی و با REF مجتمع با کمپلکس های تقاطع اگزونی و همچنین پروتئین های mRNP دیگر، به طور متقارن به اغلب mRNA ها متصل می شوند.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#رونویسی توسط RNA پلیمراز I

The process of transcription initiation by Pol I and Pol Ill is similar to that by Pol II but requires different genera transcription factors, is directed by different promoter elements and does not require hydrolysis of ATP β-γ phosphodieste bonds to separate the DNA strands at the start site as Pol II transcription does.
فرآیند شروع رونویسی توسط RNA پلیمراز I و RNA پلیمراز III شبیه RNA پلیمراز ll است ولی نیاز به عوامل رونویسی متفاوت دارد که توسط عناطر پروموتر متفاوت هدایت می شود و هیرولیز پیوند فسفو دی استری ATP β-γ
را برای جدا کردن دو رشته DNA در نقطه آغاز را نیاز ندارد.


Pol I transcribes only a single RNA, the 45S precursor of 18S, 5.8S, and 28S rRNA, from multiple copies of the pre_rRNA gene.
پلیمراز l تنها یک RNA، پیش ساز 45s از rRNA های 18s, 28sو 5/8s ، از چندین کپی از ژن _rRNA را رونویسی می کند.





https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#پردازش pre_rRNA

A class of snoRNAs called box C+D snoRNAs is involved in ribos 2′-O-methylation. Sequences in the snoRNA illustrated here hybridize to two different regions in the pre-rRNA, directing methylation at the indicated sites.

یک sno RNA به نام جعبه C+D در متیلاسیون ’۲_o_ ریبوز دخالت میکند. توالی این sno RNA با دو ناحیه مختلف در rRNA اولیه هیبرید تشکیل داده و متیلاسیون را به جایگاه های مشخص هدایت می کنند.


A Box H+ACA snoRNAs fold into two stem-loops withinternal single-stranded bulges in the stems. Pre-rRNA hybridizes to the single-stranded bulges, demarcating a site of pseudouridylation. Conversion from uridine to pseudouridine involves rotation of the thepyrimidine ring.

یک sno RNA جعبه H+ACA به صورت دو حلقه و ساقه با برآمدگی های درونی تک رشته ای در ساقه تا می خورند.pre_rRNA با برآمدگی های تک رشته ای هیبرید تشکیل داده و جایگاه سودویوریدین شدن را مشخص می کند. تبدیل یوریدین به سودویوریدین شامل چرخش حلقه پیریمیدینی می باشد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4zn

#تجمع کمپلکس ریبوزومی



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#تجمع کمپلکس ریبوزومی

This U3 snoRNA is assembled into a large snoRNP containing some 70 proteins, called the small subunit (SSU) processome, which specifies cleavage at site A0, the initial cut near the 5′ end of the pre-rRNA.

این U3snoRNA به صورت یه snoRNP بزرگ تقریبا با 70پروتئین بنام پردازشگر با زیرواحد کوچک(UUS) مجتمع شده و به طور اختصاصی در جایگاه A0 برش ایجاد میکند. اولین برش در نزدیک انتهای ’5 rRNA اولیه.

The first cleavage to initiate processing the rRNAs of the large subunit is performed by RNase MRP, a complex nine proteins with an RNA.

اولین برش برای شروع پردازش rRNA زیرواحد بزرگ با RNA آز MRP انجام می شود. RNA آز MRP کمپلکس از 9پروتئین به همراه یک RNA است.

The final steps in the maturation of the small ribosomal subunit occur in the
cytoplasm:
1_ processing of the 20S rRNA into18S rRNA by the cytoplasmic 5′→3′ exoribonuclease XRN1,
2_ the dimethylation of two adja- cent adenines near the 3′ end of 18S rRNA by the cytoplas-mic enzyme Dim1.

بلوغ نهایی زیرواحد کوچک ریبوزومی در سیتوپلاسم روی می دهد که شامل:
۱_پردازش 20s rRNA به صورت 18s بالغ توسط اگزونوکلئاز ’5 به ’3 سیتوپلاسمی Xrn1
2_ دی متیلاسیون دو آدنین مجاور و نزدیک انتهای ’3 از 18s rRNA توسط آنزیم سیتوپلاسمی Dim 1 انجام می گیرد، می باشد.




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#خروج پروتئین ها (مثل 60s rRNA) از هسته به سیتوپلاسم




https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#خروج پروتئین ها (مثل زیرواحد 60s rRNA) از هسته به سیتوپلاسم

The unidirectional nature of protein export and importthrough nuclear pores results from the participation of Ran,a monomeric G protein that exists in different conformationswhen bound to GTP or GDP. Localization of the Ran guanine nucleotide exchange factor (Ran-GEF) in the nuclus and of the Ran GTPase-activating protein (Ran-GAP) in the cytoplasm creates a gradient with high concentrations of Ran⋅GTP in the nucleoplasm and of Ran⋅GDP in thr cytoplasm. The interaction of a cargo complex with Ran⋅GTP in the nucleoplasm causes dissociation of the complex, re-
leasing the cargo into the nucleoplasm whereas the assembly of an export cargo complex is stimulated by interaction with Ran⋅GTP in the nucleoplasm.

ماهیت یک طرفه خروج و ورود از منافذ هسته ای، ناشی از مشارکت Ran می باشد. Ran یک G پروتئین مونومری بوده و در هنگام اتصال به GTP یا GDP، کانفورماسیون های متفاوتی به خود میگیرد. مکان یابی فاکتور تعویض نوکلئوتید گوانین Ran_GAP) Ran) در هسته و پروتئین فعال کننده Ran GTPase
سیتوپلاسم باعث ایجاد شیب غلظتی، با غلظت بالای Ran.GTP در نوکلئوپلاسم و Ran.GDP در سیتوپلاسم می شود. میانکنش کمپلکس محموله با Ran. GTP در نوکلئوپلاسم باعث تجزیه کمپلکس و رها شدن محموله به داخل نوکلئوپلاسم می شود. در حالی که تجمع کمپلکس محموله خروجی از طریق میانکنش به Ran.GTP در نوکلئوپلاسم تحریک می شود.



https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg

#نکاتی درباره انتقال mRNA از هسته به سیتوپلاسم

۱_ Ran-independent nuclear export.

۲_ An RNA helicase (Dbp5) located on the cytoplasmic side of the NPC removes NXF1 and NXT1 from the mRNA in a reaction that is powered by ATP hydrolysis.

1-خروج هسته ای mRNA ها غیر وابسته به Ran.

۲- یک RNA هلیگاز (Dbp5) واقع در سمت سیتوپلاسمی NPC، در واکنشی که از نیرو هیدرولیز ATP استفاده می کند، پروتئین NXF1 و NXT1 را از m RNA جدا می کند.


https://www.tg-me.com/joinchat-AAAAAFJ8zItgrf4znNjxXg