📝 این فایل دیتای دیتابیس miRcode هست که از بخش دانلود گرفته شد؛ روی این فایل یکسری manipulation با R انجام دادم که کل اینتراکشن‌ها تو دوتا ستون قرار بگیره و جستجوی اینتراکشن‌ها براتون خیلی راحت‌تره بشه.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

درود دوستان 💐

📎 دوستان تو پارت دوم از سری آموزش‌های نحوه ساخت شبکه ceRNA، در مورد دیتابیس miRcode جهت یافتن اینتراکشن‌های بین lncRNAها و miRNAها، توضیحاتی داده می‌شه.
⭕️ توجه کنید که برای ساخت شبکه ceRNA، باید لیست ژن‌های دارای افزایش بیان (upregulated) و کاهش بیان (downregulated) رو داشته باشید. این ژن‌ها رو می‌تونید از طریق آنالیز دیتاهای مختلف به‌دست بیارید. اگه این آنالیزها رو بلد نیستید، کانال رو دنبال کنید؛ در آینده آموزش‌های بیشتری رو تو کانال قرار می‌دم. البته بدون آنالیز دیتا هم می‌تونید تو پروژه اشخاص دیگه، بخش سیستم بایولوژی و ساخت شبکه رو انجام بدید و اینطوری همکاری داشته باشید؛ بنابراین حتی اگه آنالیز دیتا بلد نیستید، آموزش‌های شبکه ceRNA رو از این کانال یاد بگیرید.

📎 تو مقالات زیر از دیتابیس miRcode استفاده شده که می‌تونید از طریق لینک‌های زیر مشاهده کنید؛ مقاله اول، یکی دیگه از مقالاتمه؛ اگه سوالی براتون پیش اومد، می‌تونید بپرسید.
⬅️ مقاله اول
⬅️ مقاله دوم
⬅️ مفهوم ceRNA: لینک پست
⬅️ استفاده از دیتابیس LncBase: لینک پست


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ بیماری پاراپارزی اسپاسمی ارثی یا پاراپلجی اسپاسمی ارثی.

💯 مباحث از جزوه جامع و جمع‌بندی امری اکسترکشن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#امری
#بیماری‌های_تک‌ژنی
#پارت۴

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ بیماری آتروفی عضلانی - نخاعی: علائم بالینی.

💯 مباحث از جزوه جامع و جمع‌بندی امری اکسترکشن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#امری
#بیماری‌های_تک‌ژنی
#پارت۴

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ بیماری آتروفی عضلانی - نخاعی: ژنتیک (بسیار مهم؛ احتمال طرح تست برای کنکور بعد).

💯 مباحث از جزوه جامع و جمع‌بندی امری اکسترکشن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#امری
#بیماری‌های_تک‌ژنی
#پارت۴

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✏️ بررسی تست ⇐

💬 در برخی از مطالعات پزشکی، شرکت‌کنندگان ممکن است ناآگاهانه علائم را برای جلب توجه وانمود (جعل) کنند که این امر منجر به داده‌های غیرقابل اطمینان می‌شود.

✅ Feign: جعل کردن، وانمود کردن
❌ Suppress: سرکوب کردن
❌ Exhibit: نشان دادن
❌ Innovate: نوآوری کردن
🔊 Medical studies: مطالعات پزشکی
🔊 Participant: شرکت‌کننده
🔊 Unknowingly: ناآگاهانه، ناخودآگاه، ندانسته
🔊 Symptoms: علائم بیماری
🔊 Gain: به دست آوردن
🔊 Attentions: توجه
🔊 Gain attention: به دست آوردن توجه، جلب توجه
🔊 Lead to: منجر شدن به
🔊 Unreliable: غیرقابل اطمینان، غیرقابل اعتماد
🔊 Data: داده، اطلاعات

⭕️ این واژه‌ها رو اشتباه حفظ نکنید: Alleviate به معنی تسکین دادن - Deviate به معنی منحرف کردن - Obviate به معنی رفع نیاز کردن - Abbreviate به معنی خلاصه کردن - Innovate به‌معنی نوآوری کردن - Renovate به‌معنی بازسازی کردن.
⭕️ همه‌ی این کلمات به معنی سرکوب کردن هستند: Oppress = Repress = Quell = Suppress = Subdue

🖥 جهت مطالعه لغات بیشتر، این هشتگ را دنبال کنید ⇦ #لغات_زبان


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#تست_زبان

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

📍 نکته ۶۴ استراخان: مرحله شکافت (Cleavage) و فشرده‌سازی (Compaction) در تکوین چی هستن؟! (بسیار مهم).


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#ژنتیک
#نکات_استراخان
#نکته۶۴

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ نکته ۱ از فصل ۱۴ تامپسون؛ چند نکته در مورد علت ژنتیکی و محیطی بدشکلی‌ها (مهم).

📌 مباحث مرتبط با رفرنس امری ←
https://www.tg-me.com/GeneticsAS/1767
https://www.tg-me.com/GeneticsAS/1796
📌 تست‌ کنکور مربوط به این نکات ←
https://www.tg-me.com/GeneticsAS/1929

💯 مباحث از جزوه تامپسون.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#ژنتیک
#نکات_تامپسون
#نکته۱

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

📝 ساخت شبکه ceRNA پارت ۳: فیلتر کردن اینتراکشن‌های بین lncRNAها و miRNAها (مرحله اول).

🔒 رمز فایل (حروف بزرگ و کوچک رعایت شود): GeneticsAS


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

درود دوستان 🌹
امیدوارم حالتون خوب باشه

📌 این پیام یکی از دوستانی هست که از پست‌‌ها و مباحث کانال استفاده کردن و تونستن درصد خوبی برای درس ژنتیک تو آزمون لیسانس به پزشکی بزنن؛ بارها من تأکید کردم که برای پست‌های کانال وقت بذارید و مرور کنید، حتی روزی نیم ساعت. خیلی از دوستان با همین پست‌ها تونستن درصد خوبی تو آزمون‌های مختلف بزنن. شما تو کانال می‌تونید به مباحث مربوط به رفرنس‌های امری، تامپسون، استراخان، تست‌های ژنتیک تألیفی و کنکور سال‌های گذشته، تست‌های زبان تألیفی، لغات زبان پزشکی، پست‌های مشاوره‌ای، مباحث بیوانفورماتیک و ... دسترسی داشته باشید؛ مباحثی که جاهای دیگه ارائه می‌دن و بابتش ازتون هزینه می‌گیرن. پس پست‌ها رو از دست ندید و استفاده کنید.

📌 لیست مباحث کانال رو هم آپدیت کردم و می‌تونید از طریق این لیست، به مباحث کانال دسترسی پیدا کنید؛ برای دسترسی به این لیست، روی این لینک بزنید: لیست راهنمای کانال


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

🟡 لیست آپدیت‌شده از بهترین ویدیوهای آموزشی یوتوب در رابطه با تکنیک‌های آزمایشگاهی، بیوانفورماتیک و مهارت‌های مربوط به بایولوژی (آپدیت چهارم) 👈🏻


🤔 تکنیک‌های آزمایشگاهی 👈

🖥 تکنیک PCR (تئوری)

🖥 تکنیک PCR (عملی)

🖥 تکنیک Real-time PCR (تئوری)

🖥 تکنیک Real-time PCR (عملی)

🖥 تکنیک ARMS PCR (تئوری)

🖥 تکنیک Tetra ARMS PCR (تئوری)

🖥 تکنیک Hot start PCR (تئوری)

🖥 تکنیک Nested PCR (تئوری)

🖥 تکنیک Nested PCR (تئوری و عملی)

🖥 تکنیک RFLP (تئوری)

🖥 تکنیک Southern Blot (تئوری)

🖥 تکنیک Northern Blot (تئوری)

🖥 تکنیک Gel Electrophoresis (تئوری)

🖥 تکنیک Gel Electrophoresis (عملی)

🖥 تکنیک DNA Microarray (تئوری)

🖥 تکنیک Sanger Sequencing (تئوری)

🖥 تکنیک Pyrosequencing (تئوری)

🖥 تکنیک Illumina Sequencing (تئوری)

🖥 تکنیک فلوسایتومتری (تئوری)

🖥 تکنیک CRISPR-Cas9 (تئوری)

🖥 تکنیک ChIP-Seq (تئوری)

🖥 تکنیک ATAC-Seq با توضیحات کوتاه (تئوری)

🖥 تکنیک ATAC-Seq با توضیحات تکمیلی (تئوری)

🖥 استخراج RNA با استفاده از trizol (تئوری)

🖥 استخراج RNA با استفاده از trizol (عملی)

🖥 سنتز cDNA (تئوری)


🤔 دیتابیس‌های زیستی 👈

🖥 آشنایی با دیتابیس NCBI

🖥 آشنایی با دیتابیس UCSC

🖥 آشنایی با دیتابیس TCGA

🖥 آشنایی با دیتابیس Xena Browser

🖥 آشنایی با دیتابیس Enrichr

🖥 آشنایی با دیتابیس gprofiler


🤔 مهارت‌های بیوانفورماتیکی 👈

🖥 طراحی پرایمر PCR با استفاده از ابزار primer blast دیتابیس NCBI

🖥 طراحی پرایمر PCR با استفاده از وبسایت Primer3plus

🖥 طراحی پرایمر Real-time PCR با استفاده از ابزار primer blast دیتابیس NCBI

🖥 بررسی اختصاصیت پرایمرهای طراحی‌شده با استفاده از primer blast دیتابیس NCBI

🖥 بررسی اختصاصیت پرایمرهای طراحی‌شده با استفاده از in silico PCR دیتابیس UCSC

🖥 آشنایی با مفهوم Gene Ontology

🖥 نحوه‌ی دانلود دیتاهای سرطان با استفاده از دیتابیس TCGA

🖥 آنالیز دیتای Microarray با استفاده از ابزار GEO2R

🖥 آنالیز دیتای فلوسایتومتری با استفاده از نرم‌افزار Flowjo

🖥 آموزش آنالیز شبکه هم‌بیانی وزن‌دار (WGCNA)

🖥 آموزش زبان برنامه‌نویسی R سطح مبتدی

🖥 آموزش زبان برنامه‌نویسی Python سطح مبتدی

🖥 آموزش کتابخانه numpy در پایتون
🟢 توضیحات: کتابخانه‌ای در پایتون جهت انجام اعمال ریاضی مختلف روی Arrayها

🖥 آموزش کتابخانه pandas در پایتون
🟢 توضیحات: کتابخانه‌ای در پایتون جهت دست‌ورزی دیتاها

🖥 آموزش کتابخانه matplotlib در پایتون
🟢 توضیحات: کتابخانه‌ای در پایتون جهت رسم نمودارهای مختلف

🖥 آموزش پکیج ggplot2 در R
🟢 توضیحات: بهترین و کامل‌ترین پکیج در R جهت رسم نمودارهای مختلف

🖥 آموزش پکیج dplyr در R
🟢 توضیحات: پکیجی در R جهت دست‌ورزی دیتاها

🖥 مجموعه ویدیوهای آمار و آمار زیستی

🖥 مجموعه ویدیوهای تئوری آنالیز بقا (Survival analysis)

🖥 انجام آنالیز بقا در زبان برنامه‌نویسی R

🖥 مجموعه ویدیوهای آموزش Graphpad Prism
🟢 توضیحات: از بهترین نرم‌افزارهای انجام کارهای آماری و رسم نمودار

🖥 مجموعه ویدیوهای آموزش Graphpad Prism (فارسی)

💬 توجه: دوستان زیرنویس انگلیسی برای همه‌ی این ویدیوها اکتیو هست و می‌تونید برای یادگیری بهتر ازش استفاده کنید. دوستانی که ویدیوهای بهتر تو یوتوب یا جاهای دیگه دیدن، می‌تونن لینکش رو برام بفرستن که من تو این لیست قرار بدم. همین‌طور این لیست به مرور زمان آپدیت می‌شه و ویدیوهای تخصصی‌تر، مخصوصا تو حوزه بیوانفورماتیک که خودم‌ ازشون استفاده کردم، به لیست اضافه می‌شن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#تکنیک
#ویدیو_آموزشی

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ بیماری نوروفیبروماتوز تیپ ۱: علائم بالینی (بسیار مهم).

💯 مباحث از جزوه جامع و جمع‌بندی امری اکسترکشن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#امری
#بیماری‌های_تک‌ژنی
#پارت۵

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✅ بیماری نوروفیبروماتوز تیپ ۱: ژنتیک (بسیار مهم؛ احتمال طرح تست برای کنکور بعد).

💯 مباحث از جزوه جامع و جمع‌بندی امری اکسترکشن.


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#امری
#بیماری‌های_تک‌ژنی
#پارت۵

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

✏️ بررسی تست ⇐

💬 یکی از چالش‌های حفظ کیفیت هوای داخلی، جلوگیری از رشد کپک قارچی در سیستم‌های تهویه است.

❌ Algae: جلبک
✅ Mold: کپک
❌ Insects: نشان دادن
❌ Pollen: گَرده
🔊 Challenge: چالش
🔊 Maintain: حفظ کردن، نگهداری کردن
🔊 Indoor: داخلی، درونی، خانگی
🔊 Air: هوا
🔊 Quality: کیفیت
🔊 Prevent: جلوگیری کردن
🔊 Growth: رشد
🔊 Ventilation: تهویه

⭕️ این واژه‌ها رو اشتباه حفظ نکنید: Detain به معنی توقیف کردن - Attain به معنی دست یافتن - Abstain به معنی اجتناب کردن - Retain به معنی حفظ کردن - Obtain به‌معنی به دست آوردن - Sustain به‌معنی تحمل کردن - Maintain به معنی نگهداری کردن و حفظ کردن - Fountain به معنی فواره و سرچشمه - Contain به معنی شامل شدن.

🖥 جهت مطالعه لغات بیشتر، این هشتگ را دنبال کنید ⇦ #لغات_زبان


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#تست_زبان

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)

📍 نکته ۶۵ استراخان: جهش‌های از دست رفتن عملکردِ مرتبط با افزاینده (بسیار مهم).


✨ جهت ثبت‌نام مشاوره و برنامه‌ریزی اختصاصی و روزانه برای کنکور ۱۴۰۴ و تهیه جزوات جامع ژنتیک پزشکی امری و تامپسون پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : مصاحبه‌ها

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#ژنتیک
#نکات_استراخان
#نکته۶۵

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)